Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXP28300 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXP28300 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXP28300 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXP28300 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXP28300 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXP28300 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXP28300 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXP28300 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXP28300 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXP28300 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXP28300 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXP28300 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXP28300 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXP28300 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LOXP28300 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXP28300 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXP28300 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXP28300 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXP28300 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LOXP28300 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms