Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HTR2AP28223 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR2AP28223 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms