Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB9P28065 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms