Protein–RNA interactions for Protein: P23919

DTYMK, Thymidylate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTYMKP23919 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DTYMKP23919 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms