Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRGP23470 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PTPRGP23470 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPRGP23470 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
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