Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KB1P23443 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB1P23443 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms