Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms