Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD58P19256 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD58P19256 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CD58P19256 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD58P19256 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD58P19256 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD58P19256 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD58P19256 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD58P19256 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD58P19256 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CD58P19256 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD58P19256 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD58P19256 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CD58P19256 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD58P19256 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD58P19256 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD58P19256 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD58P19256 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD58P19256 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD58P19256 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD58P19256 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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