Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPI1P17947 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPI1P17947 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPI1P17947 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPI1P17947 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPI1P17947 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPI1P17947 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPI1P17947 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPI1P17947 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPI1P17947 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPI1P17947 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPI1P17947 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPI1P17947 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPI1P17947 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPI1P17947 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPI1P17947 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPI1P17947 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPI1P17947 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPI1P17947 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPI1P17947 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPI1P17947 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPI1P17947 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPI1P17947 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPI1P17947 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPI1P17947 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPI1P17947 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPI1P17947 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPI1P17947 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPI1P17947 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPI1P17947 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPI1P17947 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPI1P17947 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms