Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXB9P17482 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms