Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPCAMP16422 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPCAMP16422 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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