Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA1P15085 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA1P15085 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA1P15085 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA1P15085 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA1P15085 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA1P15085 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA1P15085 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA1P15085 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA1P15085 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA1P15085 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA1P15085 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA1P15085 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA1P15085 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA1P15085 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA1P15085 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA1P15085 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA1P15085 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA1P15085 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA1P15085 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA1P15085 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA1P15085 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA1P15085 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA1P15085 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA1P15085 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA1P15085 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA1P15085 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA1P15085 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA1P15085 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA1P15085 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA1P15085 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA1P15085 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA1P15085 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA1P15085 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA1P15085 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA1P15085 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA1P15085 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA1P15085 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms