Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPBP14678 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPBP14678 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms