Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB1P14653 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB1P14653 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms