Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC5A1P13866 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms