Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT13P13646 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT13P13646 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT13P13646 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT13P13646 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT13P13646 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT13P13646 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT13P13646 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT13P13646 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT13P13646 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT13P13646 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT13P13646 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT13P13646 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT13P13646 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT13P13646 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT13P13646 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT13P13646 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT13P13646 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT13P13646 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT13P13646 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT13P13646 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT13P13646 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT13P13646 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT13P13646 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT13P13646 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT13P13646 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT13P13646 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT13P13646 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms