Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GP1BBP13224 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GP1BBP13224 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms