Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RLBP1P12271 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RLBP1P12271 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLBP1P12271 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms