Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PF4V1P10720 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms