Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHGAP10645 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHGAP10645 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHGAP10645 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHGAP10645 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHGAP10645 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CHGAP10645 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CHGAP10645 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHGAP10645 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHGAP10645 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHGAP10645 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHGAP10645 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHGAP10645 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHGAP10645 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHGAP10645 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHGAP10645 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHGAP10645 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHGAP10645 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHGAP10645 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHGAP10645 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHGAP10645 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHGAP10645 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHGAP10645 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHGAP10645 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHGAP10645 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHGAP10645 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHGAP10645 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHGAP10645 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHGAP10645 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHGAP10645 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHGAP10645 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHGAP10645 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHGAP10645 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHGAP10645 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHGAP10645 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHGAP10645 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHGAP10645 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CHGAP10645 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHGAP10645 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHGAP10645 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHGAP10645 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHGAP10645 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHGAP10645 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHGAP10645 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHGAP10645 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHGAP10645 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHGAP10645 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHGAP10645 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHGAP10645 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHGAP10645 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHGAP10645 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHGAP10645 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CHGAP10645 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHGAP10645 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHGAP10645 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHGAP10645 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHGAP10645 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHGAP10645 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHGAP10645 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHGAP10645 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHGAP10645 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHGAP10645 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHGAP10645 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHGAP10645 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHGAP10645 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHGAP10645 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHGAP10645 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHGAP10645 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHGAP10645 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHGAP10645 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHGAP10645 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHGAP10645 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms