Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR2F1P10589 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms