Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM225BP0DP42 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms