Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM17P0DL12 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms