Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms