Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00869P0C866 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms