Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB7P09629 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB7P09629 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms