Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOP08100 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOP08100 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOP08100 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOP08100 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOP08100 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOP08100 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms