Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRB1P04280 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRB1P04280 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRB1P04280 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRB1P04280 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRB1P04280 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRB1P04280 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRB1P04280 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRB1P04280 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRB1P04280 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRB1P04280 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRB1P04280 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRB1P04280 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRB1P04280 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRB1P04280 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRB1P04280 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRB1P04280 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRB1P04280 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRB1P04280 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRB1P04280 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRB1P04280 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRB1P04280 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRB1P04280 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRB1P04280 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRB1P04280 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRB1P04280 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRB1P04280 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRB1P04280 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRB1P04280 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRB1P04280 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRB1P04280 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRB1P04280 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRB1P04280 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRB1P04280 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRB1P04280 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms