Protein–RNA interactions for Protein: P02774

GC, Vitamin D-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCP02774 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCP02774 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCP02774 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCP02774 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCP02774 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCP02774 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCP02774 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCP02774 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCP02774 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCP02774 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCP02774 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCP02774 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCP02774 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCP02774 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCP02774 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCP02774 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCP02774 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCP02774 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCP02774 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCP02774 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCP02774 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GCP02774 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCP02774 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCP02774 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GCP02774 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GCP02774 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GCP02774 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCP02774 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCP02774 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GCP02774 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GCP02774 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GCP02774 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GCP02774 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GCP02774 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GCP02774 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCP02774 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCP02774 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCP02774 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GCP02774 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCP02774 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GCP02774 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCP02774 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GCP02774 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GCP02774 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCP02774 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GCP02774 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GCP02774 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GCP02774 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GCP02774 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GCP02774 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GCP02774 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GCP02774 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GCP02774 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GCP02774 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GCP02774 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
GCP02774 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GCP02774 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCP02774 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCP02774 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCP02774 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GCP02774 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCP02774 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GCP02774 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GCP02774 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GCP02774 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GCP02774 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCP02774 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms