Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBE1P02100 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBE1P02100 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBE1P02100 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms