Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTAP01374 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTAP01374 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LTAP01374 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LTAP01374 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LTAP01374 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LTAP01374 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LTAP01374 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LTAP01374 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms