Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F2P00734 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F2P00734 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F2P00734 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F2P00734 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F2P00734 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F2P00734 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F2P00734 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F2P00734 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
F2P00734 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F2P00734 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F2P00734 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F2P00734 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F2P00734 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F2P00734 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
F2P00734 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
F2P00734 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
F2P00734 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F2P00734 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F2P00734 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
F2P00734 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F2P00734 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F2P00734 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
F2P00734 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
F2P00734 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F2P00734 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms