Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD3O95983 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD3O95983 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD3O95983 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD3O95983 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD3O95983 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD3O95983 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD3O95983 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD3O95983 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD3O95983 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD3O95983 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD3O95983 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD3O95983 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD3O95983 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD3O95983 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD3O95983 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD3O95983 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD3O95983 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD3O95983 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD3O95983 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD3O95983 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD3O95983 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD3O95983 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD3O95983 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD3O95983 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD3O95983 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD3O95983 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD3O95983 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD3O95983 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD3O95983 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD3O95983 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD3O95983 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD3O95983 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD3O95983 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD3O95983 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD3O95983 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD3O95983 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD3O95983 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD3O95983 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD3O95983 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD3O95983 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD3O95983 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD3O95983 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD3O95983 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD3O95983 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD3O95983 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD3O95983 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD3O95983 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD3O95983 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD3O95983 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD3O95983 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD3O95983 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD3O95983 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD3O95983 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD3O95983 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD3O95983 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD3O95983 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD3O95983 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD3O95983 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD3O95983 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD3O95983 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms