Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD4O95243 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD4O95243 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD4O95243 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD4O95243 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD4O95243 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD4O95243 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD4O95243 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD4O95243 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD4O95243 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD4O95243 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD4O95243 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MBD4O95243 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD4O95243 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD4O95243 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD4O95243 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD4O95243 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD4O95243 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD4O95243 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD4O95243 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD4O95243 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD4O95243 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD4O95243 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD4O95243 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD4O95243 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD4O95243 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD4O95243 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MBD4O95243 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MBD4O95243 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD4O95243 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD4O95243 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD4O95243 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD4O95243 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD4O95243 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD4O95243 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD4O95243 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD4O95243 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD4O95243 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD4O95243 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD4O95243 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MBD4O95243 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MBD4O95243 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD4O95243 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD4O95243 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD4O95243 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD4O95243 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD4O95243 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD4O95243 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD4O95243 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD4O95243 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MBD4O95243 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD4O95243 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD4O95243 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD4O95243 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD4O95243 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD4O95243 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD4O95243 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD4O95243 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD4O95243 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD4O95243 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD4O95243 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD4O95243 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD4O95243 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD4O95243 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD4O95243 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD4O95243 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms