Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM13AO94988 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM13AO94988 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM13AO94988 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM13AO94988 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM13AO94988 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM13AO94988 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM13AO94988 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM13AO94988 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM13AO94988 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms