Protein–RNA interactions for Protein: O75829

CNMD, Leukocyte cell-derived chemotaxin 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMDO75829 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNMDO75829 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNMDO75829 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNMDO75829 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNMDO75829 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNMDO75829 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNMDO75829 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNMDO75829 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNMDO75829 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNMDO75829 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNMDO75829 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNMDO75829 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNMDO75829 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNMDO75829 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNMDO75829 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNMDO75829 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNMDO75829 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNMDO75829 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNMDO75829 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNMDO75829 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNMDO75829 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNMDO75829 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNMDO75829 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNMDO75829 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNMDO75829 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNMDO75829 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNMDO75829 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNMDO75829 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNMDO75829 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNMDO75829 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms