Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPS6KA4O75676 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPS6KA4O75676 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms