Protein–RNA interactions for Protein: O75380

NDUFS6, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS6O75380 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS6O75380 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS6O75380 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms