Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAMP4O75379 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAMP4O75379 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAMP4O75379 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VAMP4O75379 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAMP4O75379 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAMP4O75379 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAMP4O75379 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAMP4O75379 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAMP4O75379 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VAMP4O75379 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VAMP4O75379 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VAMP4O75379 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms