Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSCO60682 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSCO60682 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSCO60682 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSCO60682 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSCO60682 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSCO60682 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSCO60682 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MSCO60682 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSCO60682 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSCO60682 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSCO60682 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MSCO60682 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSCO60682 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MSCO60682 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSCO60682 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSCO60682 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSCO60682 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSCO60682 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSCO60682 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSCO60682 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSCO60682 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSCO60682 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSCO60682 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSCO60682 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSCO60682 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSCO60682 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSCO60682 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSCO60682 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSCO60682 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSCO60682 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms