Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LANCL1O43813 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms