Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKAB2O43741 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms