Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF13O43567 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF13O43567 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF13O43567 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF13O43567 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF13O43567 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF13O43567 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF13O43567 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF13O43567 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF13O43567 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF13O43567 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF13O43567 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF13O43567 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF13O43567 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF13O43567 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF13O43567 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF13O43567 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF13O43567 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF13O43567 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF13O43567 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF13O43567 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF13O43567 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF13O43567 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF13O43567 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF13O43567 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF13O43567 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF13O43567 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF13O43567 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF13O43567 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF13O43567 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF13O43567 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF13O43567 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF13O43567 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF13O43567 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF13O43567 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF13O43567 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF13O43567 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF13O43567 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF13O43567 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms