Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF3O43395 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF3O43395 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms