Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA2O43364 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA2O43364 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms