Protein–RNA interactions for Protein: O15213

WDR46, WD repeat-containing protein 46, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR46O15213 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR46O15213 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR46O15213 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR46O15213 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR46O15213 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR46O15213 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR46O15213 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR46O15213 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR46O15213 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR46O15213 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR46O15213 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR46O15213 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR46O15213 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR46O15213 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR46O15213 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR46O15213 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR46O15213 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR46O15213 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR46O15213 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR46O15213 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR46O15213 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR46O15213 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR46O15213 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR46O15213 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR46O15213 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR46O15213 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR46O15213 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR46O15213 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR46O15213 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR46O15213 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR46O15213 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR46O15213 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR46O15213 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR46O15213 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR46O15213 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR46O15213 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR46O15213 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR46O15213 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR46O15213 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR46O15213 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR46O15213 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR46O15213 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR46O15213 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR46O15213 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR46O15213 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR46O15213 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR46O15213 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR46O15213 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR46O15213 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR46O15213 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR46O15213 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms