Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IKBKBO14920 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms