Protein–RNA interactions for Protein: O14829

PPEF1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF1O14829 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPEF1O14829 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPEF1O14829 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPEF1O14829 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPEF1O14829 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPEF1O14829 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPEF1O14829 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPEF1O14829 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPEF1O14829 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPEF1O14829 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPEF1O14829 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPEF1O14829 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPEF1O14829 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPEF1O14829 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPEF1O14829 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPEF1O14829 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms