Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP2O14595 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms