Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PITPNM1O00562 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITPNM1O00562 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms